میکروبیولوژی از بخش های مهم آزمایشگاهی شامل میکروب شناسی ، انگل شناسی ، و قارچ شناسی است. در این بخش ، کشت نمونه های مختلف بیماران به منظور بررسی میکروارگانیسم ها ، تست حساسیت به آنتی بیوتیک ها و بررسی نمونه ها ی بیماران صورت می گیرد. در واقع نمونه های خون ، ادرار ، مایعات مختلف بدن و … زیر میکروسکوپ و کشت واقع شده و بررسی لازم انجام شده و در نهایت نتایج آنتی بیوگراف. پس از تست های آنتی بیوگرام محاسبه و ارزیابی می شود.